この出会いの地理。船はどこから出港し、どこに錨を下ろし、この世紀はどこで決したのか。地図は模式図であり、距離は縮尺どおりではない。各点はそれぞれの項目にリンクしている。
模式図（縮尺は正確ではない）
1543年、嵐に流されたポルトガル商人が漂着した九州南方の島。記録に残る最初のヨーロッパ人の来日である。彼らが島の若き領主に売った火縄銃は数か月で複製され、「種子島」は銃そのものを指す日本語となった。
種子島、1543年、最初の接触と日本を変えた銃 · レコンキスタから種子島へ：イベリア辺境の十字軍はいかにして日本の浜辺に至ったか
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1549年、フランシスコ・ザビエルが日本宣教を開くために上陸した薩摩の港。導き手は、日本最初のキリスト教改宗者となった逃亡者アンジローであった。島津氏の歓迎は一年足らずで冷め、宣教は先へ進む。信仰の最初の足場は、大名政治の最初の教訓ともなった。
登場する記事：日葡交流の全年表 1543–1650年 · アルヴァレス報告書：ヨーロッパ初の日本の肖像 · キリシタンの世紀、封建日本における信仰と権力 · 日本のキリシタン改宗者数、1549–1700年 · 平戸のイルマン・ロレンソ──教会を築いた盲目の琵琶法師 · とどまった男──コスメ・デ・トーレスと日本宣教の長き十年
九州北西部、松浦氏の島の港。長崎以前にはポルトガル船の主要な寄港地であり、のちにオランダ商館（1609年）とイギリス商館（1613年）が置かれた。三十年にわたり日本におけるプロテスタントの橋頭堡であったが、1641年、オランダ人は出島へ移された。
赤い獅子と朱印状、一六〇九年、オランダの平戸到着 · ウィリアム・アダムスとプロテスタントの衝撃
登場する記事：日葡交流の全年表 1543–1650年 · リスボンから長崎へ──世界で最も危険な航海 · 種子島、1543年、最初の接触と日本を変えた銃 · キリシタンの世紀、封建日本における信仰と権力 · 日本のキリシタン改宗者数、1549–1700年 · フランシスコ・ザビエルと日本イエズス会布教 · 平戸のイルマン・ロレンソ──教会を築いた盲目の琵琶法師 · 京都に歩み入った男：ガスパル・ヴィレラと帝都への布教 · ほか22件
1571年、大村純忠がポルトガル船に開いた漁村。1580年にイエズス会へ寄進され、1587年に秀吉に没収された──そのころにはすでに日本貿易の新興都市にして、アジアで最もキリスト教的な町であった。幕府の下では国内唯一の監視された対外窓口となり、迫害の最も陰惨な舞台ともなった。
長崎、漁村から世界貿易の中心地へ · 最後の使節：マカオの最終賭博、長崎1640年
登場する記事：レコンキスタから種子島へ：イベリア辺境の十字軍はいかにして日本の浜辺に至ったか · 日葡交流の全年表 1543–1650年 · リスボンから長崎へ──世界で最も危険な航海 · キリシタンの世紀、封建日本における信仰と権力 · 日本のキリシタン改宗者数、1549–1700年 · 平戸のイルマン・ロレンソ──教会を築いた盲目の琵琶法師 · とどまった男──コスメ・デ・トーレスと日本宣教の長き十年 · オ・デゼジャード──ドン・セバスティアンと二つの帝国に取り憑いた亡霊 · ほか51件
1636年、ポルトガル人を収容するため長崎港に築かれた扇形の人工島。その三年後、代金を払い終える前にポルトガル人は追放された。1641年からはオランダ人が置かれ、以後二世紀、この埋立ての一区画がヨーロッパにとって日本への唯一の扉であった。
鎖国、日本はいかにして、なぜ門戸を閉ざしたのか · 閉ざされた扉の向こうで：日本はいかにして鎖国のなかで自らを再発明したか
登場する記事：日葡交流の全年表 1543–1650年 · 帝国の辺境の都市：ポルトガル領マカオの歴史 · ナウ・ド・トラト、ポルトガルの日本渡航大船 · 長崎、漁村から世界貿易の中心地へ · 南蛮の台所、ポルトガルと日本の料理交流における時代のレシピ · 日本語の中のポルトガル語、言語の考古学 · ウィリアム・アダムスとプロテスタントの衝撃 · 東インド会社：VOCはいかにして大洋を征服し、一つの島を受け継いだか · ほか11件
長崎の東に広がる半島と島々。かつてのキリシタン大名の土地であり、苛烈な徴税と迫害が1637〜38年の大一揆に火をつけた。原城での籠城はおよそ三万七千の命を奪い、ポルトガル人追放という幕府の結論を決定づけた。
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豊後（現在の大分）の大友氏の府城下。大友宗麟の庇護のもと、宣教の初期の本拠地となった。日本最初のヨーロッパ式病院が置かれ、一世代にわたり国内で最も安全なキリシタンの地であった──1586〜87年、島津軍が大友氏の力を打ち砕くまでは。
とどまった男──コスメ・デ・トーレスと日本宣教の長き十年 · 京都に歩み入った男：ガスパル・ヴィレラと帝都への布教
登場する記事：フランシスコ・ザビエルと日本イエズス会布教 · 平戸のイルマン・ロレンソ──教会を築いた盲目の琵琶法師 · 巡察師：アレッサンドロ・ヴァリニャーノと日本布教の再建 · 紙の戦争──日本カトリック宣教はいかにして自壊したか
畿内の縁に立つ自治都市。日本随一の交易拠点にして鉄砲鍛冶の町であり、種子島の火縄銃を一つの産業へと変えた場所である。その自治は信長の下で終わったが、堺の商人と鉄砲は天下統一のあらゆる戦役を左右した。
第六天魔王と僧侶たち：織田信長の仏教勢力との戦い · 銀の重さ：南蛮貿易の度量衡・貨幣・商業の仕組み
登場する記事：日葡交流の全年表 1543–1650年 · 種子島、1543年、最初の接触と日本を変えた銃 · 平戸のイルマン・ロレンソ──教会を築いた盲目の琵琶法師 · 帝国の辺境の都市：ポルトガル領マカオの歴史 · ナウ・ド・トラト、ポルトガルの日本渡航大船 · 京都に歩み入った男：ガスパル・ヴィレラと帝都への布教 · うつけ殿から第六天魔王へ：織田信長の生涯と人物像 · 人の値段：ポルトガルによる日本人奴隷貿易 · ほか9件
天皇の都──宣教師たちには「都（ミヤコ）」。1559年、ヴィレラがここに宣教の第二戦線を開いた。その教会・南蛮寺は信長の庇護のもとに建ち、最初の迫害とともに倒れた。宣教の命運は、つねにこの都で決せられたのである。
京都に歩み入った男：ガスパル・ヴィレラと帝都への布教 · 安土宗論：信長の仕組まれた裁判とキリシタン日本の黄金時代
登場する記事：足利から安土へ：日本の戦国時代への道 · 徳川幕府のキリシタン迫害 1617–1640 ― 幕府はいかにして棄教者の製造を学んだか
秀吉の城下町にして豊臣氏の本拠。信長が十年を費やして攻め落とした本願寺の要害の跡に築かれた。1614〜15年の大坂の陣での落城は豊臣家を滅ぼし──キリシタン武士たちの最後の大きな拠り所も、ともに失われた。
大坂の陣：最後の戦いと十字架の旗 · 猿が神となるとき：豊臣秀吉の生涯と人物像
登場する記事：日葡交流の全年表 1543–1650年 · 種子島、1543年、最初の接触と日本を変えた銃 · 日本のキリシタン改宗者数、1549–1700年 · 帝国の辺境の都市：ポルトガル領マカオの歴史 · ナウ・ド・トラト、ポルトガルの日本渡航大船 · 京都に歩み入った男：ガスパル・ヴィレラと帝都への布教 · 南蛮鶏：チキン南蛮の数奇な歴史 · 銀の重さ：南蛮貿易の度量衡・貨幣・商業の仕組み · ほか23件
徳川の首府（現在の東京）。1603年から幕府の所在地となり、反キリシタンの機構が設計された場所である。江戸が命じ、長崎が執行する──迫害の地理は、この二都市のあいだを走っていた。
従順なる子：徳川秀忠と迫害の機構 · 統べるために生まれて：徳川家光と支配の完成
登場する記事：キリシタンの世紀、封建日本における信仰と権力 · 帝国の辺境の都市：ポルトガル領マカオの歴史 · ナウ・ド・トラト、ポルトガルの日本渡航大船 · 南蛮鶏：チキン南蛮の数奇な歴史 · 南蛮の台所、ポルトガルと日本の料理交流における時代のレシピ · 銀の重さ：南蛮貿易の度量衡・貨幣・商業の仕組み · 天ぷらからカステラへ、南蛮がもたらした食の遺産 · ジョアン・ロドリゲス・ツウズ：帝国のために語った通訳 · ほか26件
京都の北東にそびえ、天台宗の総本山・延暦寺を頂く山。数世紀にわたり僧兵を擁し、都のいまひとつの大勢力であった。1571年、信長は全山を焼き討ちして数千人を殺した。この破壊は畿内における仏教の武力を打ち砕き、宣教師たちはその空白へ説教をもって入り込んだ。
第六天魔王と僧侶たち：織田信長の仏教勢力との戦い · 安土宗論：信長の仕組まれた裁判とキリシタン日本の黄金時代
登場する記事：キリシタンの世紀、封建日本における信仰と権力 · 平戸のイルマン・ロレンソ──教会を築いた盲目の琵琶法師 · 京都に歩み入った男：ガスパル・ヴィレラと帝都への布教 · うつけ殿から第六天魔王へ：織田信長の生涯と人物像 · 屈しなかった軍人：フランシスコ・カブラルと日本の魂をめぐる戦い · 高山右近：神を選び日本を捨てた武士 · 天下人の南征、秀吉の1587年九州征伐
琵琶湖畔に信長が築いた城下町。1576〜79年、新しい秩序の象徴として、水田の上に金と漆の七重の天主がそびえた。イエズス会は教会とセミナリヨの土地を与えられ、1579年には宣教団への信長の好意を裏づけた宗論の舞台となった。城も町も、1582年の信長の死から数週のうちに焼け落ちた。
安土宗論：信長の仕組まれた裁判とキリシタン日本の黄金時代 · 足利から安土へ：日本の戦国時代への道
登場する記事：キリシタンの世紀、封建日本における信仰と権力 · 日本のキリシタン改宗者数、1549–1700年 · 平戸のイルマン・ロレンソ──教会を築いた盲目の琵琶法師 · とどまった男──コスメ・デ・トーレスと日本宣教の長き十年 · うつけ殿から第六天魔王へ：織田信長の生涯と人物像 · 屈しなかった軍人：フランシスコ・カブラルと日本の魂をめぐる戦い · 第六天魔王と僧侶たち：織田信長の仏教勢力との戦い · 高山右近：神を選び日本を捨てた武士 · ほか2件
伊達政宗の城下町にして北の大藩の府。その沿岸の月浦で1613年、ガレオン船サン・フアン・バウティスタ号が建造・進水し、慶長遣欧使節をメキシコ、そしてローマへと運んだ——この世紀に太平洋を二度渡った唯一の日本製の船である。
ポルトガル領インドの首府にして、アジア帝国の行政の心臓部。日本へ向かうすべての航海、宣教師、公文書がここを経由した。インドへ去るカブラルも、日本へ向かうヴァリニャーノも、ローマの前にまずゴアに従ったのである。
レコンキスタから種子島へ：イベリア辺境の十字軍はいかにして日本の浜辺に至ったか · 巡察師：アレッサンドロ・ヴァリニャーノと日本布教の再建
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1511年、アルブケルケが奪った海峡の都市。インド洋と中国海域を結ぶ航路の要である。1547年、ザビエルはここでアンジローに出会った──イエズス会の眼を日本へ向けさせた対話である。
レコンキスタから種子島へ：イベリア辺境の十字軍はいかにして日本の浜辺に至ったか · リスボンから長崎へ──世界で最も危険な航海
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1550年代から中国沿岸に築かれたポルトガル人居留地。明の認可を受け、ただ一つの特権──中国の絹と日本の銀を仲介する合法的な地位──によって富を築いた。日本貿易がその教会を建て、守備隊を養った。1639年の追放は、この町をほとんど破綻させかけた。
帝国の辺境の都市：ポルトガル領マカオの歴史 · ナウ・ド・トラト、ポルトガルの日本渡航大船
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スペイン領フィリピンの首府。太平洋ガレオン船の終着港であり、フランシスコ会が日本宣教へ入る門戸でもあった──イエズス会が決して歓迎しなかった競合である。1596年のサン・フェリペ号の難破は最初の大殉教の導火線に火をつけた。高山右近は1615年、この地で客死した。
サン・フェリペ号事件：ある使命を沈めた難破船 · 高山右近：神を選び日本を捨てた武士
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チャオプラヤー川に臨むシャム王国の都にして自由港。朱印船貿易の大きな目的地のひとつで、千人規模の日本人町と、その隣のポルトガル人居留地を擁した。1628年、スペインのガレオン船が幕府公認のジャンク船をここで拿捕し、日本の対マニラ姿勢を硬化させる外交危機の引き金となった。
アユタヤ事件 ― 独断のスペイン人が日本船を焼き、ポルトガルに二年分の銀を失わせた顛末
登場する記事：種子島、1543年、最初の接触と日本を変えた銃 · 南蛮の台所、ポルトガルと日本の料理交流における時代のレシピ · ウィリアム・アダムスとプロテスタントの衝撃 · 戦利品、オランダによる「サント・アントニオ」号拿捕事件